马蹄参为孑遗植物，是主产我国的单种属，该属原隶属五加科。但果实大型，外果皮坚硬，1室，仅1粒种子，胚弯曲等特征与五加科不同，而与山茱萸科中的单室茱萸属Mastixia或隐核茱萸属Tectocarya．较为接近或相似，故有学者将它归人山茱萸科。因此，马蹄参对研究五加科、山茱萸科的系统发育和古地理、古气候都具有科学价值。分布区内一些地方已建立自然保护区，应加强对本种的保护、研究与繁殖。目前对马蹄参尚未进行引种驯化，行种子休眠、发芽、育苗和栽培等试验。